How does the antidepressant ESCitalopram work & Prospects for Rationally Designing of new 'Antidepressants' .. the 3D-structural perspective.
كيف يعمل مضاد الإكتئاب ESCitalopram وآفاق التصميم العقلاني لأدزية "مضادة للإكتئاب" .. من منظور التركيب الفراغي ..


A number of 3D-structures have been determined, using x-ray crystallography, 2016, of the Human Serotonin Transporter many in complex forms bound with selected derivatives of the antidepressant ESCitalopram. The structures contribute towards gaining incites into the working mechanism of the antidepressant and analysing the intriguing discovery that ESCitalopram can also bind to the allosteric site of the Serotonin transporter in addition to the central active site !!
Follow the SSFS tool links provided below and see the attached images.

تراكيب ثلاثية الأبعاد، تم القيام بتحقيقها، سنة 2016، بتقنية علم البلورات باستخدام الأشعة السينية، لمكونات تمثل معقد بروتيني لـ: ناقل السيروتونين البشري Human Serotonin Transporter متحدا مع مجموعة مرشحة من مشتقات مضادات الإكتئاب ESCitalopram. الدراسات هذه تساهم في فهم كيفية عمل هذه المضادات واكتشافات جديدة حول إمكانية إرتباط هذه الأخيرة مع الموقع الألوستيري لناقل السيروتونين بالإضافة إلى الموقع الفعال المركزي !!. أنظر روابط تطبيق الـ SSFS أدناه والصور المرفقة.

Such discovery has set this protein as important target for the new and more effective antidepressants via the Rational Drug Design and alike techniques.

هذا الإكتشاف من شأنه أن يجعل هذا النوع من البروتين محط التركيز والإهتمام في إطار التصميم العقلاني للأدوية Rational Drug Design لمضادات إكتئاب جديدة وأكثر فعالية.

For more details, follow the link:
للإطلاع على أهمية معرقة البنية الفراغية لهذا المعقد البروتيني وتفاصيل الموضوع، تابع الرابط التالي:

🖝 At last, scientists solve structure of protein that antidepressants target

The technical papers is available in Nature:
البحث الأصلي ، مجلة الطبيعة Nature، على الرابط:

🖝 X-ray structures and mechanism of the human serotonin transporter

Exploration of the 3D-structures and binding detail is available via the SSFS tool, on the Bioinformaticstools.org web-site, Deprt. of Biology, University of Saida:
يمكن إستكشاف تفاصيل البنية الفراغية لهذه المعقدات البروتينية باستخدام تطبيق الـ SSFS على موقع المعلوماتية الحيوية، قسم البيولوجيا، جامعة سعيدة، الجزائر:

🖜 1- ناقل-السيراتونين البشري TS2 (الحالة الغير مرتبطة Apo form)
https://bioinformaticstools.org/ssfs/ssfs.php?qry=5i6z

🖜 2- ناقل-السيراتونين البشري TS3 في حالة ارتباط بالدواء مضاد الإكتئاب Paroxetine والمعروف تجاريا بـ Paxil أو Pexeva أو Seroxat .. وأسماء أخرى
https://bioinformaticstools.org/ssfs/ssfs.php?qry=5i6x

🖜 3- ناقل-السيراتونين البشري TS3 في حالة ارتباط بالدواء مضاد الإكتئاب S-Citalopram (في حالة الشبيه الضوئي S-(+) ) .. الإرتباط مع الموقع الفعال المركزي. هذا الدواء معروف بالإسم ESCitalopram ويعرف تجاريا بـ Cipralex أو Lexapro وأسماء أخرى.
https://bioinformaticstools.org/ssfs/ssfs.php?qry=5i71

🖜 4- ناقل-السيراتونين البشري TS3 في حالة ارتباط ثنائي الموقع بالدواء مضاد الإكتئاب S-Citalopram (في حالة الشبيه الضوئي S-(+) ) .. الإرتباط مع الموقع الفعال المركزي ومع الموقع الألوستيري.
https://bioinformaticstools.org/ssfs/ssfs.php?qry=5i73

🖜 5- ناقل-السيراتونين البشري TS3 في حالة ارتباط بدواء تحت الدراسة وهو مشتق من المركب S-Citalopram ويسمى بـ Br-Citalopram حيث تم استبدال مجموعة الفلييور بالبروم .. الإرتباط مع الموقع الفعال المركزي.
https://bioinformaticstools.org/ssfs/ssfs.php?qry=5i74

🖜 6- ناقل-السيراتونين البشري TS3 في حالة ارتباط بدواء الدواء S-Citalopram والمشتق Br-Citalopram .. كلاهما يرتبط مع الموقع الفعال المركزي.
https://bioinformaticstools.org/ssfs/ssfs.php?qry=5i75

The structures can also be explored using the PDB database;
يمكن كذلك إستكشاف هذه التراكيب على موقع قاعدة بيانات التراكيب البروتينية:

🖝 https://pdbe.org

🖝 https://www.rcsb.org


Article images

أجمل التحيات .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. All the best

  Author:  Abdelkrim Rachedi
  E-mail:   rachedi@bioinformaticstools.org
  Date:      - 14 April 2021