Biological Function & Structure of the hydrolase enzyme, Cyanogenic β-glucosidase, from the "Repens sp" plant.
الوظيفة البيولوجية و التركيب الفراغي لإنزيم Cyanogenic β-glucosidase من نبات " البرسيم ".


The enzyme Cyanogenic β-glucosidase (CBG) an important catalytic agent found in many plants that contain Cyanoglucosides which are used as deterrent of grazing animals though the cleavage action of the CGG enzyme which lead to the production of the poisinous gaz of HCN.

The 3D-structure, the subject of the article, image 1, is from the white clover, Trifolium repens image 2, shows a single domain concentrated fold (alpha/beta)8 barrel.

This barrel fold constitutes a pocket site for a sugar-binding that lends the sugar substrate such as the cyanoglucosides to clivage of the Cyanide gas HCN off the sugar residue there by allowing the enzyme to perform biological functions amongst which deterring grazing animal from finishing off the plants.

إنزيم Cyanogenic β-glucosidase أو CBG يتواجد في العديد من النباتات المحتوية على جليكوسيدات-السيانيد cyanoglucosides و التي تستعمله النباتات كمادة طاردة لآكلات العشب حيث يدخل الإنزيم في تحليل الجليكوسيدات محررا بذلك غاز السيانيد HCN السام ..

التركيب الفراغي موضوع المقال هو للإنزيم CBG، الصورة 1، من نبات البرسيم الأبيض الصورة 2 ، تبين البنية ثلاثية-الأبعاد لهذا الإنزيم حيث يتشكل من نمط برميلي مزدوج ثماني ألفا-بيتا fold (alpha/beta)8 barrel في نطاق كلي_التمركز.

هذا النمط التركيبي البرميلي له دور ربط السكريات مثل cyanoglucosides و تسهيل عملية فصل غاز السيانيد HCN عن مشتقات السكريات للإضطلاع بالوظيفة البيولوجية التي تضم ردع الحيوانات عن أكل الأعشاب إلى حد القضاء الكامل عليها.

Exploration of this enzyme's structure can be performed using the tool SSFS ❇️ provided via the BioinformaticsTools website, the link below, Department of Biology, University of Saida, Algeria.

The SSFS enables users to also find the taxonomy classification of the enzyme , biological function and many other related and important features, follow the link:

يمكن استكشاف هذا التركيب الفراغي باستخدام التطبيق SSFS ❇️ من موقع المعلوماتية_الحيوية، جامعة سعيدة، الجزائر.

هذا التطبيق، على الرابط أدناه، يوفر معلومات هامة بما فيها تصنيف هذا الإنزيم ووظيفـتة االبيولوجية وتفاصيل أخرى عن طبيعة التركيب ثلاثي الأبعاد للإنزيم وغيره من الجزيئات البيولوجية:

🖝 https://bioinformaticstools.org/ssfs/ssfs.php?qry=1cbg - image 1

Furthermore, the FIMA-v2 database, also made available via the Bioinformatics server, provide important data about another plant from the same species, Agropyron repens, image 3, the entry of which supplies integrated data on more related 3D-structures amongst which the CBG enzyme, see image 4. This features can be accessed using the FIMA-v2 link below:

بالإضافة إلى ذلك، توفر قاعدة البيانات-فيما-2 (FIMA-v2) معلومات مهمة عن نبات آخر من نفس الفصيلة و هو Agropyron repens ، الصورة 3، حيث قسم البيانات_المدمجة لـ فيما-2 FIMA Data Integeration module يكتشف تراكيب فراغية إضافية ذات العلاقة من بينها لـ إنزيم CBG - موضوع هذا المقال - الصورة 4. هذه الخاصية يمكن الولوج إليها عبر روابط فيما-2 أدناه:

🖝 https://www.bioinformaticstools.org/fima/index.php?submit=Search&search=station1 - image 3

Then click the image or the link associated with : Agropyron repens

ثم انقر الصورة أو الرابط المتوفر في قائمة النتائج المعلق بـ Agropyron repens

❇️ SSFS: Sequence, Structure and Function Server by the Structural Biology & Bioinformatics Groups, Biology Dept, Faculty of Science, University of Saida, Algeria
نظام: سلسلة التركيب الأولي، التركيب الفراغي و الوظيفة البيولوجية ، فريق البيولوجيا ثلاثية الأبعاد و المعلوماتية الحيوية، قسم البيولوجيا، كلية العلوم، جامعة سعيدة، الجزائر
🖝 https://bioinformatics.univ-saida.dz/bit2/?arg=SB3


أجمل التحيات                                                         All the best

  Author:  Abdelkrim Rachedi
  E-mail:   abdelkrim.rachedi@univ-saida.dz
  Date:      - 15 August 2022

Images

Cyanogenic β-glucosidase entry in the SSFS online application.
Image 1. Cyanogenic β-glucosidase entry in the SSFS online application.

White clover; <b><i>Trifolium repens</i></b>
Image 2. White clover; Trifolium repens

FIMA-v.2 Data Integration providing links to many more rich data including 3d-structures, proteomic, genomic data and scientific publications.
Image 3. FIMA-v.2 Data Integration providing links to many more rich data including 3d-structures, proteomic, genomic data and scientific publications.

Agropyron repens entry in the online FIMA-v.2 database.
Image 4. Agropyron repens entry in the online FIMA-v.2 database.