Concept article: Minireviews


The Structure of Diamond .. & Structural Biology
البنية_الفراغية للماس .. و البيولوجيا التركيبية




RACHEDI Abdelkrim

Laboratory of Biotoxicology, Pharmacognosy and biological valorisation of plants, Faculty of Sciences, Department of Biology, University of Saida - Dr Moulay Tahar, 20100 Saida, Algeria.

📧 E. mail: abdelkrim.rachedi@univ-saida.dz

Published: 01 August 2022

William Henry Bragg and his son Lawrence were the first to study diamond using X-ray diffraction and publish their findings in the journal Nature 31 July 1931, link below.

كان ويليام هنري براج وابنه لورانس أول من درس الماس باستخدام حيود الأشعة السينية ونشروا النتائج التي توصلوا إليها في مجلة Nature، 31 جويليا 1931 ، الرابط أدناه.

The method was, in those days, a new method for defining atomic positions and arrangement in crystallized materials; they revolutionized the ideas about chemical bonds in solids.

تقنية إستخدام حُيُود الأشعة السينية كانت ، في تلك الأيام ، موضوعا جديدا في تحديد المواقع الذّرية و معرفة ترتيبها في المواد المتبلورة؛ لقد أحدثوا بذلك ثورة كبيرة في الأفكار حول طبيعة الروابط الكيميائية في المواد الصلبة.

🖝 The Crystal Structure of Diamond      --  Image 1

W.H. and W.L. Bragg were awarded the 1915 Nobel Prize in Physics "for their services in the analysis of crystal structure by means of X-rays."

حصل ويليام هنري وويليان لورانس براغ على جائزة نوبل في الفيزياء عام 1915 "لخدماتهما في تحليل التركيب البلوري باستخدام الأشعة السينية."

🖝 https://www.nobelprize.org/prizes/physics/1915/summary/

The success of the Braggs opened a new revolution in many areas of science including in the creation of Structural Biology, Image 5, the field that medicine and rational drug design owes their success.

فتح نجاح الأب و الإبن براج Bragg ثورة جديدة في العديد من مجالات العلوم بما في ذلك إنشاء علم البيولوجيا التركيبية (ثلاثية الأبعاد)، Image 5 ، وهو المجال الذي تدين فيه نجاحات الطب وتصميم الأدوية العقلاني و غيرها بالنجاح.

In particular, the Image 5 summarises the pivotal role of Structural Biology such as decifering the relation between the 3D structure of some important molecules and their biological function: "Ribosome 1J5E and 1/2 Gyrase 1AB4 Fragment Ribisco 1RCX Transfer RNA 4TNA Antibody 1IGT Phenylalanyi-tRNA Synthetase 1EIY Simian Virus 40 1SVA Apoptosome-Procaspase-9 caspase-9 Rhodopsin complex 1F88 3IZA Simian Virus 4 Capsid Protein 1SVA Prefoldin 1FXK Dehydrofolase 1DHF Pepsin SPEP Elongation Factor 1EFU ua and nd Ts Filament 3G37 Alcohol Dehydrogenase Dehydr 20HX Hemoglobin 4HB RNA polymerase 3AOH Myoglobin 1MBD Adenovirus NIYL Cycloaxygenase 1PTH Lysozyme 1LZ1 Adenovirus virus Hexon Protein 3IYN Thermosome 3LOS GroEL/GroES chaperonin IAON 200A Insulin 2HIU Insect Flight Muscle 2W49"

على وجه الخصوص، يلخص الشكلImage 5 الدور المحوري للبيولوجيا البنيوية، مثل فك رموز العلاقة بين البنية ثلاثية الأبعاد لبعض الجزيئات المهمة ووظائفها البيولوجية: "الريبوسوم (1J5E)، وجزء من إنزيم الجيراز (1AB4)، والريبيسكو (1RCX)، والحمض النووي الريبي الناقل (4TNA)، والجسم المضاد (1IGT)، وإنزيم تخليق فينيل ألانيل-tRNA (1EIY)، وفيروس القردة 40 (1SVA)، ومعقد الأبوبتوسوم-Procaspase-9-caspase-9 (1F88)، والرودوبسين (3IZA)، وبروتين القفيصة لفيروس القردة 4 (1SVA)، والبروتين المرافق Prefoldin (1FXK)، وإنزيم ثنائي هيدرو الفولات ريدوكتاز (1DHF)، والبيبسين (SPEP)، وعامل الاستطالة (1EFU)، وخيط Ts (3G37)، وإنزيم نازع هيدروجين الكحول (20HX)، والهيموغلوبين (4HB)، وإنزيم بوليميراز الحمض النووي الريبي (3AOH)، والميوغلوبين (1MBD)، والفيروس الغدي (NIYL)، وإنزيم الأكسدة الحلقية (1PTH)، والليزوزيم (1LZ1)، وبروتين الهيكسون للفيروس الغدي (3IYN)، والثيرموسوم (3LOS)، والبروتين المرافق GroEL/GroES (1AON)، والأنسولين (2HIU)، وعضلة طيران الحشرات (2W49)".

For some introduction into Structural Biology, follow the link:
لأخذ فكرة عن البيولوجية التاركيبية، تابع الرابط التالي:

🖝 Structural Biology      --  a Wikipedia article




Images

The Structure of Diamond: Energy in bound system is quantized.
Image 1. The Structure of Diamond: Energy in bound system is quantized.

Blue diamond
Image 2. Blue diamond

William Henry Bragg
Image 3. William Henry Bragg

William Lawrence Bragg
Image 4. William Lawrence Bragg

Structural Biology; examples of protein structure
Image 5. Structural Biology; examples of protein structure