The NALD database (v.2 2021): Ligand binding 3D-Motifs in DNA ..
قاعدة-بيانات NALD (إصدار 2.0 - 2021) لِـ نماذج الإرتباط ثلاثية-الأبعاد للمتفاعلات الجزيئية مع الحمض النّووي DNA.

The NALD or Nucleic Acids and Ligands❇️ Database provides valuable data pertaining to specific interacting DNA motifs, modes and types of ligand binding for a large number of small molecules comprising drugs, inhibitors.

نظام NALD يمثل قاعدة-بيانات لنماذج تركيبية ثلاثية-الأبعاد مع تفاصيل لأنماط الترابط❇️ بين قائمة كبيرة من المتفاعلات الجزيئية مثل الأدوية والمثبطات وغيرها من الجزيئات الصغيرة مع أجزاء محددة من الحمض النّووي DNA.

The 'Binding Motifs' are annotated with details including the binding modes, nature of the bonds and their types made between the ligands and the DNA in addition to many other details. See images 1 and 2 which depicts examples of data provided by the NALD database.

أنماط الإرتباط هذه مبينة بتفاصيل حول كيفية الإرتباط، أطوال وأنواع الروابط الموجودة بين هذه الجزيئات والـ DNA وتقاصيل مهمة أخرى. كأمثلة على نوعية ودقة البيانات التي توفرها قاعدة-البيانات NALD أنظر الصور 1 و 2 المرفقة أدناه.

Detailed knowledge of these DNA ligands Binding Motifs are important to many areas of research including Rational Drug Design of new and effective drugs against diseases such as cancer and many other DNA based and Gene regulation related.

هذا النّوع من البحوث والبيانات المرفقة معها من شأنها أن تُرشد الباحثين في شتى المجالات البيولوجية بما فيها الصيدلة والطب للمساعدة على القيام بتصاميم عقلانية لأدوية جديدة فعالة ضد الأمراض الخطيرة منها السرطان والأيدز وغيرها.

NALD database is endowed with its own search engine and made is available online by the Structural Biology & Bioinformatics group, Department of Biology, University of Saida, Algeria, via the URL link below:

قاعدة-البيانات الـ NALD مزودة بمحرك-بحث خاص بها، متوفرة على الرابط الموالي على صفحة الواب أدوات_في_المعلوماتية_الحيوية BioinformaticsTools ، من إنتاج و تطوير فريق البحث العلمي "البيولوجيا الفراغية و المعلوماتية الحيوية"، قسم البيويوجيا، جامعة سعيدة، الجزائر:

http://www.bioinformaticstools.org/nald/

Reference / Primary citation :
ورقة البحث التقني متوفرة على المرجع التالي:

Abdelkrim Rachedi et.al., NALD: Nucleic Acids and Ligands Database Modeling Approaches and Algorithms for Advanced Computer Applications (Springer) 2013, 488: 329-336

المرجع متوافر عبر الإنترنت عبر موقع مجلات springer على الرابط:
Available online:

https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-319-00560-7_36

تفحص كذلك الصور المرفقة أدناه .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. Inspect also the attached images

أزكى التحيات .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . .. . All the best

❇️ Ligand (متفاعلات الجزيئية) includes natural substrates, inhibitors and Medicines/Drugs
متفاعلات الجزيئية تتضمن الجزيئات الطبيعية (الركائز)، المثبطات و الأدوية.

  Author:  A. Rachedi
  E-mail:   rachedi@bioinformaticstools.org
  Date:      - 11 January 2022

Images:
Image 1. " Types of results A, B, C and D when searching NALD of the ligand CRB or 5-bromo-2IaposI-deoxycytidine 5IaposI-(dihydrogen phosphate) "
Image 1." Types of results A, B, C and D .. "
Image 2. " Main interface of the NALD database. Three methods of searching and exploring the DNA Binding Motifs; 1. search by keyword. 2. Exploring by molecules/structure types and 3. Exploring by Binding Motifs Classes."
Image 2." Main interface of the NALD database .. "
Image 3. " Search results displaying Binding Motifs classes details per ligands.  "
Image 3." Search results displaying Binding Motifs classes details per ligands. "
Image 4. " The research paper of the NALD database:<br><a href="https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-319-00560-7_36">https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-319-00560-7_36</a>"
Image 4." The research paper of the NALD database .. "
Image 5. " "
Image 5." The research paper of the NALD database .. "
Image 6. " "
Image 6." .. "