Failed to fetch secondary structure data from PDBe API for PDB ID: 1dgf.

Protein-Ligand Contacts
Entry: 1dgf | 3D viewOXIDOREDUCTASE
Protein-Ligand Environment
Protein
Residues
LigandBonds
ChainSStr-ElmNameNumberAtom ChainNameNumberAtom Distance/ÅPossible
Bond Type
DNo-SSEARG 72 CA DHEM3003 O2A 3.84van der Waals
DNo-SSEARG 72 CB DHEM3003 O2A 3.67van der Waals
DNo-SSEARG 72 CG DHEM3003 CGA 3.71van der Waals
DNo-SSEARG 72 CG DHEM3003 O1A 3.74van der Waals
DNo-SSEARG 72 CG DHEM3003 O2A 3.47van der Waals
DNo-SSEARG 72 CD DHEM3003 O2D 3.74van der Waals
DNo-SSEARG 72 NE DHEM3003 O1A 3.88H.Bond
DNo-SSEARG 72 NE DHEM3003 CGD 3.71H.Bond
DNo-SSEARG 72 NE DHEM3003 O2D 2.85H.Bond
DNo-SSEARG 72 CZ DHEM3003 O2D 3.66van der Waals
DNo-SSEARG 72 NH2 DHEM3003 O2D 3.6H.Bond
DNo-SSEVAL 73 CG1 DHEM3003 C3A 3.97van der Waals
DNo-SSEVAL 73 CG1 DHEM3003 CMA 3.46van der Waals
DNo-SSEVAL 74 CG2 DHEM3003 CHA 3.74van der Waals
DNo-SSEVAL 74 CG2 DHEM3003 C1A 3.32van der Waals
DNo-SSEVAL 74 CG2 DHEM3003 C2A 3.55van der Waals
DNo-SSEVAL 74 CG2 DHEM3003 C3A 3.85van der Waals
DNo-SSEVAL 74 CG2 DHEM3003 C4A 3.81van der Waals
DNo-SSEVAL 74 CG2 DHEM3003 NA 3.55H.Bond
DNo-SSEHIS 75 CB DHEM3003 C3D 3.89van der Waals
DNo-SSEHIS 75 CB DHEM3003 CAD 3.5van der Waals
DNo-SSEHIS 75 CG DHEM3003 C2D 3.93van der Waals
DNo-SSEHIS 75 CG DHEM3003 C3D 3.47van der Waals
DNo-SSEHIS 75 CG DHEM3003 C4D 3.72van der Waals
DNo-SSEHIS 75 CG DHEM3003 CAD 3.63van der Waals
DNo-SSEHIS 75 ND1 DHEM3003 C2D 3.72H.Bond
DNo-SSEHIS 75 ND1 DHEM3003 C3D 3.7H.Bond
DNo-SSEHIS 75 ND1 DHEM3003 CMD 3.98H.Bond
DNo-SSEHIS 75 ND1 DHEM3003 CAD 3.91H.Bond
DNo-SSEHIS 75 CD2 DHEM3003 CHA 3.84van der Waals
DNo-SSEHIS 75 CD2 DHEM3003 C1D 3.89van der Waals
DNo-SSEHIS 75 CD2 DHEM3003 C2D 3.91van der Waals
DNo-SSEHIS 75 CD2 DHEM3003 C3D 3.57van der Waals
DNo-SSEHIS 75 CD2 DHEM3003 C4D 3.35van der Waals
DNo-SSEHIS 75 CD2 DHEM3003 ND 3.62H.Bond
DNo-SSEHIS 75 CE1 DHEM3003 C1D 3.77van der Waals
DNo-SSEHIS 75 CE1 DHEM3003 C2D 3.57van der Waals
DNo-SSEHIS 75 CE1 DHEM3003 C3D 3.91van der Waals
DNo-SSEHIS 75 CE1 DHEM3003 CMD 3.87van der Waals
DNo-SSEHIS 75 NE2 DHEM3003 CHD 3.96H.Bond
DNo-SSEHIS 75 NE2 DHEM3003 C1D 3.47H.Bond
DNo-SSEHIS 75 NE2 DHEM3003 C2D 3.69H.Bond
DNo-SSEHIS 75 NE2 DHEM3003 C3D 3.84H.Bond
DNo-SSEHIS 75 NE2 DHEM3003 C4D 3.76H.Bond
DNo-SSEHIS 75 NE2 DHEM3003 ND 3.59H.Bond
DNo-SSEARG 112 CB DHEM3003 O1D 3.4van der Waals
DNo-SSEARG 112 CG DHEM3003 O1D 3.35van der Waals
DNo-SSEARG 112 CD DHEM3003 CGD 3.88van der Waals
DNo-SSEARG 112 CD DHEM3003 O1D 3.2van der Waals
DNo-SSEARG 112 CD DHEM3003 O2D 3.74van der Waals
DNo-SSEARG 112 NE DHEM3003 O1D 3.94H.Bond
DNo-SSEARG 112 CZ DHEM3003 O1D 3.81van der Waals
DNo-SSEARG 112 NH1 DHEM3003 CGD 3.44H.Bond
DNo-SSEARG 112 NH1 DHEM3003 O1D 2.83H.Bond
DNo-SSEARG 112 NH1 DHEM3003 O2D 3.71H.Bond
DNo-SSEGLY 131 CA DHEM3003 CMD 3.51van der Waals
DNo-SSEPHE 132 N DHEM3003 CMD 3.84H.Bond
DNo-SSEVAL 146 O DHEM3003 CHD 3.87van der Waals
DNo-SSEVAL 146 O DHEM3003 CAC 3.38van der Waals
DNo-SSEVAL 146 O DHEM3003 CBC 3.47van der Waals
DNo-SSEVAL 146 CG1 DHEM3003 C1D 3.8van der Waals
DNo-SSEVAL 146 CG1 DHEM3003 C2D 3.64van der Waals
DNo-SSEVAL 146 CG1 DHEM3003 CMD 3.77van der Waals
DNo-SSEGLY 147 CA DHEM3003 CBC 3.92van der Waals
DNo-SSEGLY 147 C DHEM3003 CAC 3.76van der Waals
DNo-SSEGLY 147 O DHEM3003 CMD 3.19van der Waals
DNo-SSEASN 148 N DHEM3003 CAC 3.76H.Bond
DNo-SSEASN 148 N DHEM3003 CBC 3.88H.Bond
DNo-SSEASN 148 CB DHEM3003 CAC 3.71van der Waals
DNo-SSEASN 148 CG DHEM3003 CHD 3.97van der Waals
DNo-SSEASN 148 CG DHEM3003 C3C 3.8van der Waals
DNo-SSEASN 148 CG DHEM3003 CAC 3.3van der Waals
DNo-SSEASN 148 OD1 DHEM3003 CHD 3.58van der Waals
DNo-SSEASN 148 OD1 DHEM3003 CAC 3.84van der Waals
DNo-SSEASN 148 ND2 DHEM3003 CHD 3.97H.Bond
DNo-SSEASN 148 ND2 DHEM3003 C2C 3.83H.Bond
DNo-SSEASN 148 ND2 DHEM3003 C3C 3.23H.Bond
DNo-SSEASN 148 ND2 DHEM3003 C4C 3.72H.Bond
DNo-SSEASN 148 ND2 DHEM3003 CAC 3.09H.Bond
DNo-SSEPHE 153 CD2 DHEM3003 CMC 3.96van der Waals
DNo-SSEPRO 158 CA DHEM3003 CBB 3.72van der Waals
DNo-SSEPRO 158 CB DHEM3003 CBB 3.45van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CG DHEM3003 C2B 3.7van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CG DHEM3003 C3B 3.67van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CG DHEM3003 CMB 3.8van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CG DHEM3003 CAB 3.66van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CD1 DHEM3003 C1B 3.94van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CD1 DHEM3003 C2B 3.47van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CD1 DHEM3003 C3B 3.9van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CD1 DHEM3003 CMB 3.46van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CD2 DHEM3003 C2B 3.94van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CD2 DHEM3003 C3B 3.47van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CD2 DHEM3003 C4B 3.93van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CD2 DHEM3003 CAB 3.41van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CE1 DHEM3003 CHB 3.59van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CE1 DHEM3003 C1B 3.43van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CE1 DHEM3003 C2B 3.5van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CE1 DHEM3003 C3B 3.96van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CE1 DHEM3003 CMB 3.92van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CE1 DHEM3003 NB 3.95H.Bond
DNo-SSEPHE 161 CE2 DHEM3003 CHC 3.92van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CE2 DHEM3003 C2B 3.97van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CE2 DHEM3003 C3B 3.54van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CE2 DHEM3003 C4B 3.47van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CE2 DHEM3003 CAB 3.9van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CE2 DHEM3003 NB 3.9H.Bond
DNo-SSEPHE 161 CZ DHEM3003 C1B 3.53van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CZ DHEM3003 C2B 3.76van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CZ DHEM3003 C3B 3.79van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CZ DHEM3003 C4B 3.62van der Waals
DNo-SSEPHE 161 CZ DHEM3003 NB 3.53H.Bond
DNo-SSEGLY 216 O DHEM3003 CBC 3.45van der Waals
DNo-SSESER 217 CB DHEM3003 CBC 3.53van der Waals
DNo-SSESER 217 OG DHEM3003 CBC 3.25van der Waals
DNo-SSEHIS 218 NE2 DHEM3003 CMC 3.83H.Bond
DNo-SSELEU 299 CD2 DHEM3003 CMC 3.73van der Waals
DNo-SSEPHE 334 CD2 DHEM3003 CBD 3.93van der Waals
DNo-SSEPHE 334 CD2 DHEM3003 CGD 3.57van der Waals
DNo-SSEPHE 334 CD2 DHEM3003 O2D 3.46van der Waals
DNo-SSEPHE 334 CE2 DHEM3003 CGD 3.73van der Waals
DNo-SSEPHE 334 CE2 DHEM3003 O1D 3.81van der Waals
DNo-SSEPHE 334 CE2 DHEM3003 O2D 3.68van der Waals
DNo-SSEMET 350 O DHEM3003 CBB 3.42van der Waals
DNo-SSEMET 350 SD DHEM3003 CBB 3.74van der Waals
DNo-SSEMET 350 CE DHEM3003 CAB 3.62van der Waals
DNo-SSEMET 350 CE DHEM3003 CBB 3.8van der Waals
DNo-SSEARG 354 CG DHEM3003 C2B 3.87van der Waals
DNo-SSEARG 354 CG DHEM3003 C3B 3.55van der Waals
DNo-SSEARG 354 CG DHEM3003 C4B 3.79van der Waals
DNo-SSEARG 354 CG DHEM3003 CAB 3.82van der Waals
DNo-SSEARG 354 CG DHEM3003 CBB 3.85van der Waals
DNo-SSEARG 354 CD DHEM3003 CHC 3.5van der Waals
DNo-SSEARG 354 CD DHEM3003 C3B 3.94van der Waals
DNo-SSEARG 354 CD DHEM3003 C4B 3.68van der Waals
DNo-SSEARG 354 CD DHEM3003 C1C 3.81van der Waals
DNo-SSEARG 354 NE DHEM3003 CHC 3.5H.Bond
DNo-SSEARG 354 NE DHEM3003 C4B 3.67H.Bond
DNo-SSEARG 354 NE DHEM3003 C1C 3.37H.Bond
DNo-SSEARG 354 NE DHEM3003 C2C 3.77H.Bond
DNo-SSEARG 354 NE DHEM3003 C4C 3.98H.Bond
DNo-SSEARG 354 NE DHEM3003 NB 3.83H.Bond
DNo-SSEARG 354 NE DHEM3003 NC 3.51H.Bond
DNo-SSEARG 354 CZ DHEM3003 C1C 3.64van der Waals
DNo-SSEARG 354 CZ DHEM3003 C2C 3.62van der Waals
DNo-SSEARG 354 CZ DHEM3003 C3C 3.57van der Waals
DNo-SSEARG 354 CZ DHEM3003 C4C 3.6van der Waals
DNo-SSEARG 354 CZ DHEM3003 NC 3.61H.Bond
DNo-SSEARG 354 NH1 DHEM3003 C2C 3.78H.Bond
DNo-SSEARG 354 NH1 DHEM3003 C3C 3.77H.Bond
DNo-SSEARG 354 NH1 DHEM3003 CBC 3.78H.Bond
DNo-SSEARG 354 NH2 DHEM3003 CHD 3.46H.Bond
DNo-SSEARG 354 NH2 DHEM3003 C1C 3.93H.Bond
DNo-SSEARG 354 NH2 DHEM3003 C2C 3.98H.Bond
DNo-SSEARG 354 NH2 DHEM3003 C3C 3.5H.Bond
DNo-SSEARG 354 NH2 DHEM3003 C4C 3.16H.Bond
DNo-SSEARG 354 NH2 DHEM3003 CAC 3.98H.Bond
DNo-SSEARG 354 NH2 DHEM3003 C1D 3.99H.Bond
DNo-SSEARG 354 NH2 DHEM3003 NC 3.43H.Bond
DNo-SSEALA 357 CB DHEM3003 CMB 3.95van der Waals
DNo-SSETYR 358 CE1 DHEM3003 CHA 3.68van der Waals
DNo-SSETYR 358 CE1 DHEM3003 C1A 3.47van der Waals
DNo-SSETYR 358 CE1 DHEM3003 C4A 3.99van der Waals
DNo-SSETYR 358 CE1 DHEM3003 C4D 3.8van der Waals
DNo-SSETYR 358 CE1 DHEM3003 NA 3.43H.Bond
DNo-SSETYR 358 CE1 DHEM3003 ND 3.78H.Bond
DNo-SSETYR 358 CE1 DHEM3003 FE 3.8Metalic Bond
DNo-SSETYR 358 CE2 DHEM3003 CHB 3.78van der Waals
DNo-SSETYR 358 CE2 DHEM3003 C4A 3.84van der Waals
DNo-SSETYR 358 CE2 DHEM3003 C1B 3.76van der Waals
DNo-SSETYR 358 CE2 DHEM3003 NA 3.87H.Bond
DNo-SSETYR 358 CE2 DHEM3003 NB 3.86H.Bond
DNo-SSETYR 358 CE2 DHEM3003 FE 3.95Metalic Bond
DNo-SSETYR 358 CZ DHEM3003 CHB 3.91van der Waals
DNo-SSETYR 358 CZ DHEM3003 C1A 3.71van der Waals
DNo-SSETYR 358 CZ DHEM3003 C4A 3.57van der Waals
DNo-SSETYR 358 CZ DHEM3003 C1B 3.94van der Waals
DNo-SSETYR 358 CZ DHEM3003 NA 3.12H.Bond
DNo-SSETYR 358 CZ DHEM3003 NB 3.67H.Bond
DNo-SSETYR 358 CZ DHEM3003 ND 3.7H.Bond
DNo-SSETYR 358 CZ DHEM3003 FE 3.07Metalic Bond
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 CHB 3.93van der Waals
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 CHD 3.75van der Waals
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 C1A 3.72van der Waals
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 C4A 3.66van der Waals
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 C1B 3.61van der Waals
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 C4B 3.74van der Waals
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 C1C 3.68van der Waals
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 C4C 3.47van der Waals
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 C1D 3.51van der Waals
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 C4D 3.69van der Waals
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 NA 2.89H.Bond
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 NB 2.87H.Bond
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 NC 2.8H.Bond
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 ND 2.81H.Bond
DNo-SSETYR 358 OH DHEM3003 FE 2Metalic Bond
DNo-SSETHR 361 CB DHEM3003 CMA 3.97van der Waals
DNo-SSETHR 361 CG2 DHEM3003 CMA 3.77van der Waals
DNo-SSETHR 361 CG2 DHEM3003 CBA 3.65van der Waals
DNo-SSETHR 361 CG2 DHEM3003 CGA 3.79van der Waals
DNo-SSETHR 361 CG2 DHEM3003 O2A 3.59van der Waals
DNo-SSEHIS 362 CD2 DHEM3003 CGA 3.65van der Waals
DNo-SSEHIS 362 CD2 DHEM3003 O1A 3.26van der Waals
DNo-SSEHIS 362 CD2 DHEM3003 O2A 3.95van der Waals
DNo-SSEHIS 362 CE1 DHEM3003 O1A 3.9van der Waals
DNo-SSEHIS 362 NE2 DHEM3003 CBA 3.84H.Bond
DNo-SSEHIS 362 NE2 DHEM3003 CGA 3.3H.Bond
DNo-SSEHIS 362 NE2 DHEM3003 O1A 2.72H.Bond
DNo-SSEARG 365 CD DHEM3003 O2A 3.55van der Waals
DNo-SSEARG 365 NE DHEM3003 CGA 3.55H.Bond
DNo-SSEARG 365 NE DHEM3003 O1A 3.47H.Bond
DNo-SSEARG 365 NE DHEM3003 O2A 2.85H.Bond
DNo-SSEARG 365 CZ DHEM3003 O1A 3.59van der Waals
DNo-SSEARG 365 CZ DHEM3003 O2A 3.74van der Waals
DNo-SSEARG 365 NH1 DHEM3003 CGA 3.8H.Bond
DNo-SSEARG 365 NH1 DHEM3003 O1A 2.94H.Bond
DNo-SSEARG 365 NH1 DHEM3003 O2A 3.85H.Bond
DHOH5007 O DHEM3003 CMD 3.58van der Waals
DHOH5007 O DHEM3003 CAD 3.74van der Waals
DHOH5007 O DHEM3003 CBD 3.9van der Waals
DHOH5007 O DHEM3003 CGD 3.68van der Waals
DHOH5007 O DHEM3003 O1D 2.7H.Bond
DHOH5035 O DHEM3003 CBC 3.57van der Waals
DHOH5044 O DHEM3003 CMC 3.66van der Waals
DHOH5044 O DHEM3003 CAC 3.71van der Waals
DHOH5044 O DHEM3003 CBC 3.56van der Waals
DHOH5057 O DHEM3003 CGA 3.83van der Waals
DHOH5057 O DHEM3003 O1A 2.77H.Bond
DHOH5057 O DHEM3003 CBD 3.58van der Waals
DHOH5057 O DHEM3003 CGD 3.54van der Waals
DHOH5057 O DHEM3003 O2D 2.76H.Bond
DHOH5175 O DHEM3003 CHD 3.73van der Waals
DHOH5175 O DHEM3003 C1C 3.63van der Waals
DHOH5175 O DHEM3003 C3C 3.95van der Waals
DHOH5175 O DHEM3003 C4C 3.38van der Waals
DHOH5175 O DHEM3003 NC 3.27H.Bond
Download Environment in CSV